Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGF29Q96ES7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms