Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCN3Q96D15 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN3Q96D15 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms