Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C12orf43Q96C57 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf43Q96C57 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms