Protein–RNA interactions for Protein: Q96BM1

ANKRD9, Ankyrin repeat domain-containing protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD9Q96BM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD9Q96BM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD9Q96BM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD9Q96BM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD9Q96BM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD9Q96BM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD9Q96BM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD9Q96BM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms