Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP35Q8NFH5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms