Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF557Q8N988 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF557Q8N988 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF557Q8N988 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms