Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NECAB1Q8N987 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECAB1Q8N987 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECAB1Q8N987 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms