Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNE4Q8N205 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNE4Q8N205 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNE4Q8N205 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms