Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HCC1LQ7Z5L2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1LQ7Z5L2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms