Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms