Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRRC9Q6ZRR7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRC9Q6ZRR7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC9Q6ZRR7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC9Q6ZRR7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms