Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB1D4Q6XE38 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB1D4Q6XE38 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms