Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO38Q6PIJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO38Q6PIJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms