Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYSMD4Q5XG99 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYSMD4Q5XG99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYSMD4Q5XG99 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms