Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC181Q5TID7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms