Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RSPH4AQ5TD94 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RSPH4AQ5TD94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RSPH4AQ5TD94 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms