Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC122Q5T0U0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms