Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WASHC2DQ5SRD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms