Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47AQ5JRC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM47AQ5JRC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms