Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO48Q5FWF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO48Q5FWF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO48Q5FWF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO48Q5FWF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO48Q5FWF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms