Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTDC1Q4AE62 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTDC1Q4AE62 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms