Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF56Q15929 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF56Q15929 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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