Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LAPTM4AQ15012 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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