Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD9Q14511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD9Q14511 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
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