Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNAPC2Q13487 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAPC2Q13487 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
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