Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIGQ13278 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIGQ13278 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIGQ13278 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIGQ13278 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIGQ13278 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIGQ13278 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RIGQ13278 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RIGQ13278 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIGQ13278 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIGQ13278 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIGQ13278 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIGQ13278 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIGQ13278 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms