Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFIAQ12857 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFIAQ12857 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
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