Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3C1Q12789 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C1Q12789 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms