Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 CDC11YJR076C 1248 nt6.32□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 SLD7YOR060C 774 nt6.32□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 DRS1YLL008W 2259 nt6.31□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 HEM3YDL205C 984 nt6.31□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 MND2YIR025W 1107 nt6.31□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 SYN8YAL014C 768 nt6.31□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 AIM3YBR108W 2844 nt6.31□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 HSM3YBR272C 1443 nt6.31□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 TOS4YLR183C 1470 nt6.3□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 ARP2YDL029W 1176 nt6.3□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 TDH3YGR192C 999 nt6.3□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 SFB3YHR098C 2790 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 VMA16YHR026W 642 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 REV7YIL139C 738 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 HOR7YMR251W-A 180 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 ROX3YBL093C 663 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 CBC2YPL178W 627 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 TRP5YGL026C 2124 nt6.29□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 TNA1YGR260W 1605 nt6.28□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 TIM54YJL054W 1437 nt6.28□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 KTR3YBR205W 1215 nt6.28□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 MSN2YMR037C 2115 nt6.28□□□□□ -1.4
RIM20Q12033 CLP1YOR250C 1338 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 SAC6YDR129C 1929 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 PRP2YNR011C 2631 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 RPT6YGL048C 1218 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 CDC43YGL155W 1131 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YHR127WYHR127W 732 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 POR1YNL055C 852 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 RAT1YOR048C 3021 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YFL034WYFL034W 3222 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 GUF1YLR289W 1938 nt6.27□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 QRI1YDL103C 1434 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 PHO8YDR481C 1701 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 GLO2YDR272W 825 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 SCW4YGR279C 1161 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YLR118CYLR118C 684 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 DFG5YMR238W 1377 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 TRP3YKL211C 1455 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 JIP4YDR475C 2631 nt6.26□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 GSY2YLR258W 2118 nt6.25□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YDL023CYDL023C 321 nt6.25□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.25□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YKL151CYKL151C 1014 nt6.25□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 HPF1YOL155C 2904 nt6.25□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 SMF3YLR034C 1422 nt6.25□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 IES1YFL013C 2079 nt6.24□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 RFA1YAR007C 1866 nt6.24□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 ULA1YPL003W 1389 nt6.24□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 KNH1YDL049C 807 nt6.24□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 ICE2YIL090W 1476 nt6.23□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 PRO3YER023W 861 nt6.23□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YMR027WYMR027W 1413 nt6.23□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 QDR1YIL120W 1692 nt6.23□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 DAL4YIR028W 1908 nt6.23□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 SNT2YGL131C 4212 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 TEA1YOR337W 2280 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 SLO1YER180C-A 258 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 NQM1YGR043C 1002 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YKL223WYKL223W 333 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 CAR1YPL111W 1002 nt6.22□□□□□ -1.41
RIM20Q12033 VCX1YDL128W 1236 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 YDR053WYDR053W 396 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 MLC1YGL106W 450 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 YBL070CYBL070C 321 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 RPS19BYNL302C 435 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 GPM3YOL056W 912 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 YOR318CYOR318C 306 nt6.21□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 VPS70YJR126C 2436 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 RIM101YHL027W 1878 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 GCS1YDL226C 1059 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 SUA5YGL169W 1281 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 LEM3YNL323W 1245 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 RER2YBR002C 861 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 TFB4YPR056W 1017 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 VHT1YGR065C 1782 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 MMP1YLL061W 1752 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 MCM6YGL201C 3054 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 DPH2YKL191W 1605 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 MSS116YDR194C 1995 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 RSC2YLR357W 2670 nt6.2□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 TOM20YGR082W 552 nt6.19□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 THI4YGR144W 981 nt6.19□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 YJL068CYJL068C 900 nt6.19□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 DEF1YKL054C 2217 nt6.18□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.18□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 BRF1YGR246C 1791 nt6.18□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 SSZ1YHR064C 1617 nt6.17□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 PAP1YKR002W 1707 nt6.17□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 FOL1YNL256W 2475 nt6.17□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 DPB2YPR175W 2070 nt6.17□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 KIP2YPL155C 2121 nt6.17□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 CBF1YJR060W 1056 nt6.16□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 ATG20YDL113C 1923 nt6.16□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 RPT4YOR259C 1314 nt6.16□□□□□ -1.42
RIM20Q12033 VMA13YPR036W 1437 nt6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms