Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms