Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23P62829 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23P62829 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23P62829 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL23P62829 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL23P62829 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23P62829 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23P62829 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23P62829 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23P62829 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL23P62829 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23P62829 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23P62829 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23P62829 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23P62829 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23P62829 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23P62829 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23P62829 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23P62829 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23P62829 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23P62829 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23P62829 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPL23P62829 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPL23P62829 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL23P62829 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms