Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERVK_113P62684 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERVK_113P62684 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms