Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VBP1P61758 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VBP1P61758 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VBP1P61758 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VBP1P61758 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VBP1P61758 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VBP1P61758 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VBP1P61758 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VBP1P61758 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VBP1P61758 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VBP1P61758 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VBP1P61758 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VBP1P61758 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VBP1P61758 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VBP1P61758 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VBP1P61758 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VBP1P61758 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VBP1P61758 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VBP1P61758 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VBP1P61758 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VBP1P61758 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VBP1P61758 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VBP1P61758 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VBP1P61758 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms