Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERVS71-1P61550 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms