Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME3P61289 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME3P61289 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME3P61289 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME3P61289 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME3P61289 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME3P61289 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME3P61289 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME3P61289 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME3P61289 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME3P61289 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME3P61289 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME3P61289 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME3P61289 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME3P61289 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME3P61289 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME3P61289 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME3P61289 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME3P61289 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME3P61289 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME3P61289 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME3P61289 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME3P61289 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME3P61289 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME3P61289 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME3P61289 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME3P61289 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms