Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3BP58499 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms