Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2A2P52657 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A2P52657 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms