Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLCP48506 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLCP48506 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLCP48506 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLCP48506 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLCP48506 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLCP48506 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLCP48506 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLCP48506 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLCP48506 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCLCP48506 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCLCP48506 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLCP48506 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLCP48506 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLCP48506 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLCP48506 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLCP48506 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLCP48506 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLCP48506 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLCP48506 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLCP48506 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLCP48506 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLCP48506 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLCP48506 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLCP48506 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLCP48506 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLCP48506 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCLCP48506 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCLCP48506 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCLCP48506 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCLCP48506 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLCP48506 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLCP48506 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLCP48506 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLCP48506 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLCP48506 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLCP48506 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLCP48506 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLCP48506 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLCP48506 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLCP48506 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLCP48506 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLCP48506 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GCLCP48506 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GCLCP48506 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms