Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC4P43686 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms