Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A2P43004 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A2P43004 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms