Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC19A1P41440 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A1P41440 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.5 ms