Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGAEP38570 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGAEP38570 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ITGAEP38570 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms