Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT2P35908 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT2P35908 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT2P35908 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT2P35908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT2P35908 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT2P35908 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT2P35908 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT2P35908 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT2P35908 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT2P35908 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT2P35908 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT2P35908 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT2P35908 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT2P35908 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT2P35908 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT2P35908 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT2P35908 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT2P35908 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT2P35908 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT2P35908 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT2P35908 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT2P35908 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT2P35908 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT2P35908 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT2P35908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT2P35908 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT2P35908 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT2P35908 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT2P35908 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT2P35908 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT2P35908 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms