Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND3P30281 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND3P30281 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND3P30281 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND3P30281 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND3P30281 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND3P30281 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND3P30281 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND3P30281 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND3P30281 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND3P30281 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND3P30281 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND3P30281 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND3P30281 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND3P30281 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND3P30281 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND3P30281 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND3P30281 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND3P30281 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCND3P30281 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCND3P30281 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCND3P30281 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCND3P30281 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCND3P30281 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCND3P30281 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCND3P30281 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCND3P30281 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND3P30281 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND3P30281 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND3P30281 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND3P30281 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND3P30281 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCND3P30281 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCND3P30281 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCND3P30281 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCND3P30281 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCND3P30281 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCND3P30281 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCND3P30281 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCND3P30281 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCND3P30281 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND3P30281 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND3P30281 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND3P30281 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCND3P30281 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCND3P30281 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCND3P30281 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCND3P30281 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCND3P30281 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms