Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2E2P29084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2E2P29084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2E2P29084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms