Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SSFA2P28290 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SSFA2P28290 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SSFA2P28290 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms