Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXD8P13378 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD8P13378 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.1 ms