Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BMP3P12645 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BMP3P12645 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BMP3P12645 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BMP3P12645 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BMP3P12645 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BMP3P12645 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BMP3P12645 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BMP3P12645 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BMP3P12645 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BMP3P12645 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BMP3P12645 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BMP3P12645 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BMP3P12645 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BMP3P12645 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BMP3P12645 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BMP3P12645 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BMP3P12645 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BMP3P12645 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BMP3P12645 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BMP3P12645 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BMP3P12645 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BMP3P12645 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BMP3P12645 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BMP3P12645 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BMP3P12645 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BMP3P12645 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BMP3P12645 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BMP3P12645 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BMP3P12645 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BMP3P12645 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BMP3P12645 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BMP3P12645 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BMP3P12645 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BMP3P12645 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BMP3P12645 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BMP3P12645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BMP3P12645 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BMP3P12645 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BMP3P12645 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BMP3P12645 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BMP3P12645 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BMP3P12645 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BMP3P12645 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BMP3P12645 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BMP3P12645 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BMP3P12645 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BMP3P12645 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BMP3P12645 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BMP3P12645 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BMP3P12645 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BMP3P12645 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BMP3P12645 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BMP3P12645 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BMP3P12645 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BMP3P12645 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BMP3P12645 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BMP3P12645 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms