Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRFP10586 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRFP10586 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRFP10586 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms