Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VIL1P09327 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VIL1P09327 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VIL1P09327 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VIL1P09327 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VIL1P09327 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VIL1P09327 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VIL1P09327 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VIL1P09327 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VIL1P09327 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VIL1P09327 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VIL1P09327 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VIL1P09327 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VIL1P09327 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VIL1P09327 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VIL1P09327 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VIL1P09327 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VIL1P09327 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VIL1P09327 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VIL1P09327 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VIL1P09327 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VIL1P09327 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VIL1P09327 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VIL1P09327 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VIL1P09327 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VIL1P09327 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VIL1P09327 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VIL1P09327 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VIL1P09327 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIL1P09327 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIL1P09327 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIL1P09327 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIL1P09327 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VIL1P09327 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIL1P09327 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIL1P09327 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VIL1P09327 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VIL1P09327 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIL1P09327 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIL1P09327 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VIL1P09327 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VIL1P09327 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VIL1P09327 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIL1P09327 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIL1P09327 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIL1P09327 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VIL1P09327 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VIL1P09327 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIL1P09327 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIL1P09327 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIL1P09327 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VIL1P09327 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIL1P09327 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VIL1P09327 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VIL1P09327 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIL1P09327 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIL1P09327 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms